通过比对基因的亲缘关系，分子生物学重塑了卡尔-冯-林奈栽下的生物进化树，人们忽然发现家猪、河马、海豚居然是亲戚。
同样的，通过比对线粒体基因和Y染色体DNA单倍群，分子生物学把人类学家餐风饮露、刨坟捡骨，好不容易搭建起来的人类进化树摇得七零八落。
人体线粒体继承自卵细胞，染色体基因变化率极其稳定，通过比对不同地区人类的基因样本，可以归纳出不同个体乃至民族之间的亲缘关系和迁徙路径，然后研究者愕然发现人类起源于20万年前的“老祖母”。同样的，男性独有的Y染色体上有一段DNA不参与交换变化率也很稳定，通过研究比对这些差异也能得出类似结果，全世界的男人始于30万年前的“老祖父”。
因为碰巧符合西方创世神话，这两位祖先就被叫做“夏娃”和“亚当”。实际上，20万年、30万年都是根据基因变化率倒算出来的大概时间，本身并不精确。而所谓“老祖母”、“老祖父”并不一定是确定的两位古人，而是具有特定基因古人类的概念集合。
历史上走出非洲的古人类有很多，现代人类的祖先恰好是最幸运的那个，全世界70亿人源自“两个人”，其实是只看结果导致的幸存者偏差。
至于那些消失的古人类，他们身上所携带的基因并没有全部湮灭在历史长河里，依然有一部分融入现代人的血脉。唯一的问题是，想要精确定量地寻找它们很不容易。尼安德特人还好，科学家在在化石碎片里找到基因碎片，通过测序发现现代人体内含有1.8~2.6%的尼安德特人基因，而山顶洞人就悲剧了，因为化石丢失，只能暂时从现代人“家谱”里移除。
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