次年,也就是1333年,元朝一代权臣燕铁木儿死亡,元惠宗妥欢贴睦尔即帝位称帝,伯颜因为拥戴元惠宗妥欢贴睦尔有功,被任命为中书右丞相、上柱国,监修国史。元统二年,升任太师、奎章阁大学士,领太史院,兼任司天监、威武、阿速诸卫。十一月,进封秦王,继领太禧宗禋院、中政院、宣政院、隆祥使司、宫相诸内府,总领蒙古、钦察、斡罗思诸卫亲军都指挥使。
中书左丞相、燕铁木儿子唐其势见伯颜独得势,认为他伴居其下,是一种莫大的耻辱,曾经气愤地说:“天下本来是我家的天下,伯颜是什么人,却位置在我之上。”就在暗地里与他叔叔塔里,阴谋发动政变,与皇室贵族诸王晃火帖木儿,在暗地里相互勾结,密谋叛变。郯王彻彻秃得知消息后,向朝廷告发了他们的阴谋。
至元元年,也就是1335年六月,伯颜采取行动,捕杀了唐其势及其弟塔剌海,皇后伯牙吾氏因为是燕铁木的女儿,想庇护她的兄弟,亦被驱逐出皇宫毒死。塔里举兵叛,杀害了朝廷的使者,向北投奔诸王晃火帖木儿。伯颜率领大军征讨他,捉拿到塔里,将他处死,晃火帖木儿畏罪自杀。七月,朝廷任命伯颜为中书右丞相,罢免了左丞相。赏赐给他“答剌罕”的称号,可以由他的子孙世代沿袭继任。从此以后,朝廷大权都全部归伯颜掌管。
朝廷中书平章彻里帖木儿,提出建议停止科举考试,几位汉族大臣据理力争,最后因为伯颜支持这条建议,停止了科举考试。至元三年,伯颜因为广东朱光卿、河南棒胡等人起兵反元,向朝廷提出报告说,汉人、南人不得当兵,掌握兵权,并收缴他们的马匹。甚至禁止农家作用铁禾叉,以防止他们造反。
伯颜又向朝廷提出报告说,皇帝应该下达诏令,禁止汉人、南人学习蒙古、色目人的文字,各中央、地方部门的长官,都用蒙古、色目人,这些都是出于伯颜的主张。他还荒唐地提出,要杀害张、王、刘、李、赵五姓汉人,后来因为元惠宗妥欢贴睦尔不依从,因而没有实行。至元四年,郯王彻彻秃进入朝廷,彻彻秃,是完泽的儿子,玉龙答失的孙子,元宪宗蒙哥的曾孙。至顺二年,也就是1331年,由武宁王进封郯王,更换为兽纽的金印。伯颜为他的儿子向郯王的女儿求婚,而遭到拒绝,他极为不满,又忌恨郯王彻彻秃位置高,威望重,就指使他人诬告他谋反,朝廷下令捕捉郯王彻彻秃下狱,后来查无实据后,竟然不等待朝廷下达诏令,擅自处决了郯王彻彻秃。五年十月,朝廷下达诏令,任命伯颜为大丞相。
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